Фамилия Хуткина — женская форма, а её мужской вариант, Хуткин, встречается редко. Сразу заметна нестандартная модель: фамилия образована не с помощью самого распространённого суффикса -ов/-ев, а с помощью -ин, который в русских фамилиях обычно присоединялся к основам на -а, -я. Здесь же основа Хутк-, что указывает на прозвище или имя Хутка. Такая форма характерна для кратких производных от крестильных имён или для прозвищ, оканчивающихся на -ка.

Самая вероятная версия — происхождение от имени Хут, которое является сокращением от крестильного имени Феофилакт (в народе — Хуфил, Хуфим). Усечение шло по законам русской народной речи: Феофилакт превращался в Хут, а затем с уменьшительным суффиксом -к- получалось Хутка. Такой путь типичен для многих старых русских фамилий: имя сокращали до одного слога, добавляли суффикс, а потом закрепляли в фамилии.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «хуткий» — так в некоторых говорах называли быстрого, проворного человека или, наоборот, того, кто «хутается» (кутается, прячется). В этом случае прозвище Хутка могло характеризовать манеру поведения или одежды. Однако церковное происхождение надёжнее: фамилии от крестильных имён составляют основу русского ономастикона, а редкие диалектные корни реже дают фамилии с суффиксом -ин.

Фамилия Хуткина географически тяготеет к центральным и северным регионам России — именно там фамилии на -ин особенно распространены. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании: вероятно, родоначальник Хутка жил в одной волости или деревне, и фамилия закрепилась в узком кругу потомков. Сословно Хуткины почти наверняка были крестьянами или мещанами — дворянские фамилии с таким корнем в исторических документах не прослеживаются.

В написании стоит обратить внимание на букву «т» в корне: некоторые носители могли записывать фамилию как Худкина (от «худой»), но это другая этимология. Устойчивое «Хуткина» сохраняет исходный звук, что помогает отличить её от омонимичных форм.