Фамилия Хуткубия — один из тех редких случаев, когда географическая привязка оказывается важнее разбора корня. Почти наверняка это абхазская фамилия, и искать её происхождение нужно в контексте абхазского языка и традиций формирования родовых имён.

В абхазском языке фамилии часто образуются при помощи суффикса -иа (в русской передаче -ия). Этот суффикс указывает на принадлежность к роду или месту. То есть Хуткубия — это «из рода Хуткуба» или «относящийся к Хуткубу». Сама основа «Хуткуб» (или «Хуткуба») — это, скорее всего, личное имя или прозвище родоначальника.

Разобрать имя «Хуткуб» по составу сложнее. В нём можно предположить два элемента: «хут» и «куб». Первая часть может восходить к абхазскому слову хәыҵ (маленький, мелкий) или к числительному хәба (пять). Вторая часть, «куб», — более тёмная. Возможно, это искажённое «губа» (сердце) или «куб» в значении «голова» (в некоторых диалектах). Правдоподобная версия: прозвище могло означать «маленькая голова» или «пятеро» (если речь о многодетности или о каком-то счёте). Однако прямое значение сегодня восстановить трудно, так как абхазская антропонимия изучена фрагментарно.

Другая, менее вероятная версия — грузинское происхождение. В грузинском суффикс -ия тоже встречается (например, фамилии Гулия, Берия), но основа «Хуткуб» нехарактерна для грузинского языка. Абхазская версия надёжнее, тем более что фамилия встречается в Абхазии и среди абхазской диаспоры.

Носители фамилии Хуткубия — это, скорее всего, потомки одного человека по имени или прозвищу Хуткуб. В традиционном абхазском обществе такие фамилии закреплялись за целым родом, и по ним можно было определить не только семью, но и место жительства предков (например, село или ущелье). Географически фамилия тяготеет к Абхазии, особенно к районам Гудауты и Очамчиры. В России она редка и встречается в основном у представителей абхазской диаспоры.

Таким образом, фамилия Хуткубия — это родовое имя с чёткой региональной и этнической окраской, образованное от прозвища предка, точное значение которого остаётся загадкой, но указывает на какую-то характерную черту (внешность, число детей и т.п.) основателя рода.