Фамилия Килганов — один из тех случаев, когда корень слова почти наверняка нерусский, а суффикс выдает обрусевшую фамилию. Основа «Килган» не встречается в древнерусских именах и прозвищах, зато имеет четкие параллели в тюркских языках. Самое вероятное объяснение: Килган — это искаженное тюркское имя или прозвище, где «кил» означает «приходи» или «приди» (повелительная форма от глагола «приходить»), а «ган» — суффикс причастия. Вместе «килган» переводится как «пришедший». Такое прозвище могли дать пришлому человеку, новоселу или тому, кто появился в селе недавно, — своего рода «пришлый». Вторая версия, менее распространенная, связывает фамилию с калмыцким или монгольским словом «килгэн» — «злой, гневный». В этом случае прозвище отражало характер: вспыльчивый или суровый человек. Оба варианта правдоподобны, но первый — с «пришедшим» — встречается в тюркской ономастике чаще.

Модель образования проста: тюркское имя или прозвище Килган + русский патронимический суффикс -ов. Это говорит о том, что носитель фамилии — потомок человека по имени или прозвищу Килган. Такая схема типична для фамилий, которые возникли в XVI–XIX веках в зонах активных контактов русских с тюркскими народами: в Поволжье, на Урале, в Сибири или в южных степях. В русских документах фамилия могла закрепиться за крестьянами, казаками или служилыми людьми, которые переняли прозвище от соседей-татар, башкир или казахов.

География фамилии сегодня не слишком широкая, но устойчивая. Килгановы встречаются в Оренбургской области, в Башкортостане и в Татарстане — именно там, где столетиями жили рядом русские и тюркские народы. Встречаются единичные носители в Москве и Санкт-Петербурге, но это уже результат миграции XX века.

С точки зрения словообразования, фамилия интересна тем, что сохранила редкую тюркскую основу, не переосмысленную в русском языке. Если сравнить с однокоренными фамилиями — например, Килганов, Килдин, Килдеев — видно, что все они восходят к разным тюркским глагольным формам. Килганов — единственная, где основа звучит как законченное действие («пришедший»), а не имя или титул. Это делает фамилию не просто прозвищем, а своего рода краткой биографией предка: он был тем, кто когда-то пришел и остался.