Вероятно, прозвище Килипута ведет свое начало от нарицательного «келеп». В «Толковом словаре живого великорусского языка» слово «келеп» имеет следующие значения «трость костылем» или «палка с молоточком». Таким образом, можно предположить, что прозвище Килип получил человек, который использовал при ходьбе костыль. Однако подобное прозвище могло отражать особенности внешности основателя рода. Возможно, он имел худощавое телосложение. Кроме этого, прозвище Килипута могло относиться к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности предка. Он мог заниматься изготовлением келепов или быть воином. Изменение, произошедшее в графическом облике фамилии Килипута (чередование гласных и/е), объясняется действием исторических процессов в языке.