Фамилия Кинисова — нечастая, но её происхождение проще, чем кажется на первый взгляд. Если отбросить типичный для южных и восточных регионов суффикс -ов/-ев, в основе лежит имя или прозвище Кинис.

Самая вероятная версия — связь с тюркским именем Кинис (или Кенис). В казахском, татарском и башкирском языках слово «кенес» означает «совет», «совещание», «согласие». Имя Кенес (вариант — Кинис) давали мальчикам с пожеланием, чтобы человек был рассудительным, умел находить общий язык с людьми, был миротворцем. Фамилия Кинисов (женская форма — Кинисова) образовалась по стандартной русской модели: к основе прибавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын Киниса». То есть первый носитель фамилии, скорее всего, был сыном человека по имени Кинис.

Вторая, менее распространённая версия, отталкивается от диалектного глагола «кинис» или «киниться» — в некоторых русских говорах так могли называть человека, который «кинится», то есть важничает, ломается, или, наоборот, суетится. Но эта гипотеза слабее: у неё нет широкой диалектной базы, и фамилия с таким прозвищем встречалась бы чаще в документах XVII–XVIII веков, чего не наблюдается.

География фамилии Кинисова тяготеет к Поволжью, Оренбуржью и Башкортостану — как раз к зоне активных русско-тюркских контактов. Это косвенно подтверждает первую версию: фамилия могла возникнуть у крещёных татар или башкир, а позже закрепиться и у русских семей, живших по соседству.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В одних семьях говорят Ки́нисова (с ударением на первый слог — ближе к тюркскому произношению), в других — Кинисо́ва (по аналогии с русскими фамилиями на -ов). Вариант с ударением на «и» (Кини́сова) встречается реже всего.

Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. В дореволюционных списках она не попадает в разряд «столбовых» — её носители не владели крепостными и не служили при дворе. Это обычная фамилия, возникшая в среде, где личное имя отца (Кинис) стало родовым прозванием для его детей.