Фамилия Киняевская — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищное происхождение. Суффикс -ск- указывает на то, что перед нами типичная «дворянская» или «географическая» модель: такие фамилии чаще всего образовывались от названия местности, которой владел род, или от места, откуда человек был родом. В отличие от массовых патронимических фамилий на -ов/-ев и -ин, которые давали по имени отца, -ский выдаёт более позднее происхождение, часто связанное с польской или западнорусской шляхтой, а также с духовенством, бравшим фамилии по названиям сёл и приходов.

Основа фамилии — Киняев- — скорее всего, восходит к топониму. В России и на Украине встречаются населённые пункты с корнем «Киня» или «Киняево». Например, существует село Киняево в Удмуртии, а также ряд деревень с похожими названиями в Костромской и Кировской областях. Если предположить, что предок носителя фамилии был выходцем из такого места, то «Киняевский» означало «принадлежащий к Киняеву» или «родом из Киняева». Суффикс -ск- в этом случае работает как указатель на территориальную принадлежность, а не на прямое родство.

Менее вероятная, но допустимая версия — происхождение от прозвища Киняй. В русских говорах слово «киня» или «кинь» могло означать нечто мелкое, незначительное (сравните с диалектным «киня» — крошка, мелкая рыбёшка). Однако в таком случае мы бы ожидали фамилию Киняев или Киняевский, но с ударением на второй слог, а не на «я». Ударение в фамилии Киняевская, как правило, падает на второй слог — Киня́евская, что дополнительно указывает на связь с топонимом (названия сёл часто сохраняют ударение основы).

О сословной принадлежности можно судить по форме. Фамилии на -ский в XVIII–XIX веках активно брало духовенство при поступлении в семинарию: ученику могли дать фамилию по названию его родного села или по храму. Поэтому Киняевская могла появиться у семинариста из села Киняево. Второй вариант — это дворянский род, владевший землёй при деревне Киняево, но подтвердить это без генеалогического древа невозможно: фамилия встречается редко и не фигурирует в известных списках столбового дворянства.

С точки зрения словообразования фамилия женская: Киняевская — это форма, которую носила женщина. Мужской вариант — Киняевский. В быту и документах XIX века женщину часто записывали по мужу или отцу в такой форме, так что искать предков стоит по мужскому роду. Фамилия остаётся редкой, не входит даже в сотню самых распространённых фамилий России, и её носители сегодня рассеяны в основном по Поволжью и северо-востоку европейской части страны, что косвенно подтверждает версию о происхождении от удмуртского или вятского топонима.