Фамилия Кипчакбаев — одна из тех, что прямо указывает на родовую принадлежность. Её основа — прозвище Кипчакбай, которое складывается из двух частей. Первая часть отсылает к кипчакам (кыпчакам) — кочевому тюркскому народу, чей союз племён сложился в Центральном и Восточном Казахстане ещё в VIII веке. Вторая часть — «бай» — древнетюркский термин, который в разные времена означал «князь», «повелитель», «хозяин» или «богатый человек». В составе имени «бай» указывало на знатное происхождение или зажиточность. Таким образом, Кипчакбай — это «богатый (знатный) человек из рода кипчаков», а Кипчакбаевы — его потомки.

Сам этноним «кипчак» исследователи выводят из древнетюркского со значением «колесо». В русских летописях кипчаков чаще называли половцами, а в европейских источниках — куманами. В XV–XVII веках, когда фамилия начала закрепляться, многие выходцы из тюркской среды, в том числе потомки золотоордынской знати, переходили на русскую службу. Их имена и прозвища становились основой для фамилий, которые оформлялись по русской модели с суффиксом -ев (от основы на -й). Именно так из Кипчакбай получился Кипчакбаев.

Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, происходят из регионов, где сохранилась память о кипчакском компоненте в этнической истории — это южный Урал, Поволжье, Западная Сибирь или Казахстан. В дореволюционной России такие фамилии могли принадлежать как служилым людям (дворянам, получившим поместья за службу), так и торговцам или духовным лицам из тюркской среды. Точно определить сословие предков без генеалогического исследования сложно, но сама структура фамилии — с именем-титулом «бай» — говорит о том, что родоначальник был человеком уважаемым и независимым.