Фамилия Киперштейн — яркий пример фамилии, образованной в среде ашкеназских евреев на территории Восточной Европы. Её основа — немецкие слова «Kiefer» (сосна) и «Stein» (камень). В буквальном переводе — «сосновый камень», что на самом деле является старым народным названием янтаря: окаменевшей смолы древних хвойных деревьев. Таким образом, прозвище Киперштейн мог получить человек, связанный с добычей или обработкой янтаря, либо торговец этим камнем.

Модель образования фамилии — чисто немецкая, характерная для позднего Средневековья, когда в городах Центральной и Восточной Европы стало модно давать «украшающие» фамилии из двух корней. В еврейской среде такие фамилии часто присваивались чиновниками при массовой паспортизации в Австрийской и Российской империях в конце XVIII — начале XIX века. В отличие от фамилий, образованных от имени отца или профессии, «ювелирные» и «природные» фамилии вроде Киперштейн (или Розенштейн, Гольдштейн) давали по случайному признаку, часто без прямой связи с реальным занятием человека.

Стоит различать фамилию Киперштейн и её вариант Киферштейн. Если «Кифер» — прямая отсылка к сосне, то «Кипер» — это адаптированная на славянской почве форма: в идише звук «ф» в некоторых диалектах переходил в «п», а в документах, записанных с чужого голоса, «п» и «ф» могли путать. Поэтому оба написания — вариации одного корня.

Географически фамилия тяготеет к территориям бывшей Австро-Венгрии и Царства Польского. Встречается в метрических книгах Галиции (ныне Западная Украина), а также в черте оседлости Российской империи. Сословно носители фамилии были в основном мещанами, реже купцами — типичными жителями местечек, где ремесло и мелкая торговля были основным занятием.

Однокоренные фамилии — Кифер, Киферман, Штейнкипер — тоже указывают на ту же образную модель: «каменщик», «человек, имеющий отношение к камню» или «сосновый камень». В русском языке фамилия склоняется по мужскому роду (Киперштейна, Киперштейну) и не склоняется по женскому.