Фамилия Киптенко — одна из тех, что начинается не с имени, а с прозвища. Её основа — слово «Кипта», а суффикс «-енко» прямо указывает на украинское происхождение: в XVI–XVII веках на Левобережной и Правобережной Украине так образовывали фамилии, означавшие «сын» или «потомок» (ср. Шевченко, Тимошенко). То есть Киптенко — буквально «сын Кипты».

Что могло означать само прозвище Кипта? Тут у этимологов нет единого мнения, но все версии сходятся на том, что оно описывало занятие или внешность предка.

Первая и самая распространённая гипотеза — профессиональная. Слово «Кипта» возводят к древнетюркскому «къыпты», что значит «ножницы». Если так, то прозвище мог получить парикмахер или портной — человек, чья работа была связана с кройкой и стрижкой. Учитывая, что на юге России и в Украине было сильное тюркское влияние (через крымских татар, ногайцев), заимствование такого корня в прозвище вполне вероятно.

Вторая версия — украинская и бытовая. Она связывает Кипту с украинским словом «кiпоть» — «сажа, осадок дыма». В этом случае прозвище давали человеку, который постоянно работал у печи: печнику, кузнецу, коптильщику рыбы или мяса. Прозвище по саже — не редкость в славянских фамилиях (ср. Сажин, Коптев), так что эта версия тоже имеет вес.

Третья гипотеза — по внешнему признаку. В некоторых русских диалектах «кипоть» означает «коготь» или «ноготь». Прозвище Кипта могли дать человеку с необычно длинными или крепкими ногтями. Эта версия менее распространена, но не исключена: прозвища по частям тела встречаются часто (Носов, Глазунов, Пальцев).

Среди этих трёх объяснений первое и второе выглядят правдоподобнее: профессиональные прозвища в крестьянской среде были массовым явлением, а вот прозвище за длинные ногти — более редкая и случайная история.

Фамилия Киптенко — украинская по форме, но с возможным тюркским или славянским корнем в основе. Её носители — потомки человека, которого в своём селе знали по ремеслу или внешней особенности.