Фамилия Киркимбаева — женская форма распространённой на юге Казахстана и в Средней Азии фамилии Киркимбаев. В её основе лежит сложносоставное тюркское мужское имя Киркимбай. Первая часть, «кирким», восходит к тюркскому корню со значением «владыка», «господин», «повелитель». Вторая часть — «бай», один из самых частотных компонентов в тюркской антропонимии, который в прошлом означал «богатый землевладелец», «скотовод», «хозяин», а со временем стал просто почётным титулом или пожеланием богатства и благополучия.

Имя Киркимбай давали мальчикам с надеждой, что они вырастут трудолюбивыми и будут жить в достатке. Словообразовательная модель здесь классическая для тюркских фамилий: к основе имени-прозвища добавлялся русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих). Окончание -а указывает на принадлежность женщине — жене или дочери Киркимбаева.

Фамилия эта — не древняя, а сформировавшаяся в XIX–XX веках, когда у тюркских народов, вошедших в состав Российской империи, начали массово закрепляться фамилии по русскому образцу. Поэтому точное место и время возникновения конкретного рода Киркимбаевых можно установить только по архивным записям: метрическим книгам, ревизским сказкам или спискам переселенцев. Географически фамилия тяготеет к южным областям Казахстана (Алматинская, Жамбылская, Туркестанская), а также встречается среди казахов и узбеков соседних регионов.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Киркимбаев стоит в одном ряду с такими, как Байкиркимов (с обратным порядком компонентов) или более простыми Баймуратов, Байбеков. Все они — «байские» фамилии, указывающие на социальный статус или пожелание его предкам. Важно не путать корень «кирким» с похожим на слух «киргиз» — это разные слова. Встречающийся в некоторых базах вариант написания «Киркимбаева» с буквой «ы» после «к» — норма для тюркского произношения, где «кы» звучит твёрже русского «ки».