Фамилия Кирлицына — женская форма фамилии Кирлицын. В русской традиции такие фамилии образуются от мужской основы с помощью суффикса -ин, указывающего на принадлежность: Кирлицын — сын Кирлицы, а Кирлицына — дочь или жена Кирлицына.

Основа фамилии — прозвище или некалендарное имя Кирлица. Оно почти наверняка восходит к древнерусскому слову «кирка» или «киркарь» — так называли работника на кирпичном заводе, того, кто делал или обжигал кирпич. В рязанских и тульских говорах «кирлица» могла означать и сам кирпич-сырец, ещё не обожжённый. Тогда Кирлица — это человек, связанный с кирпичным производством: либо мастер, либо подносчик.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «кирлыкать» — издавать гортанные звуки, кричать по-особому. В этом случае прозвище могло закрепиться за обладателем необычного голоса или за крикливым человеком. Однако связь с ремеслом надёжнее: прозвища по профессии давали часто и охотно.

Фамилия Кирлицын (и Кирлицына) — довольно редкая. Она не попала в массовые списки дворянских или купеческих родов, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Наибольшее число носителей встречается в центральных областях России — в бывших Рязанской, Тамбовской и Владимирской губерниях, где кирпичное производство было одним из главных промыслов.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в ряду таких же профессиональных прозвищ, как Гончаров, Кузнецов, Плотников. Но если эти фамилии стали массовыми, то Кирлицын остался локальным — возможно, потому, что обозначал более узкую специальность, не повсеместно распространённую.