Фамилия Кишинба — редкий случай, когда в основе лежит не русское, а тюркское слово, причём оформленное по нерусской модели. В этом её главное отличие: суффикса -ов/-ев или -ин здесь нет, окончание -а — часть основы, а не русский грамматический показатель. Такие фамилии характерны для народов Поволжья, Приуралья и Кавказа, где тюркские корни соединяются с местными фамильными формантами.

Скорее всего, Кишинба восходит к тюркскому имени или прозвищу Кишинбай. Компонент «бай» (богач, хозяин, уважаемый человек) широко распространён в башкирских, татарских, казахских и узбекских именах. Первая часть — «кишин» — может означать «человек» (от тюркского «кеше» / «киши»). Тогда Кишинбай — «богатый человек» или «уважаемый человек». Со временем конечный -й мог отпасть в устной речи, и фамилия закрепилась в форме Кишинба.

Есть и другая версия: «кишин» — искажённое «киши» (человек) плюс «ба» (смотри, гляди) — то есть прозвище вроде «смотри на человека». Но это менее убедительно: тюркские сложные имена обычно строятся по модели «определение + определяемое», а не «существительное + глагол в повелительном наклонении».

Географически фамилия Кишинба встречается в Башкортостане, Татарстане и Оренбургской области. Это подтверждает её тюркское происхождение. Предки носителя фамилии, вероятно, были башкирами или татарами, и фамилия возникла из личного имени, которое давали ребёнку с пожеланием богатства и уважения.

С точки зрения словообразования, Кишинба стоит особняком от русских фамилий на -ов и -ин. Если бы она адаптировалась по русскому образцу, то выглядела бы как Кишинбаев или Кишинбаевский, но этого не произошло. Фамилия сохранила исходную тюркскую форму, что говорит о её относительно позднем закреплении или о сильном влиянии родного языка в среде бытования.