Фамилия Кишиева — женская форма фамилии Кишиев, и её разбор стоит начать с мужского варианта, чтобы понять корни. Основа «Киши» почти наверняка тюркского происхождения. В тюркских языках слово «киши» (или «кеше») означает «человек», «мужчина», «лицо». Это одно из базовых понятий, и фамилии от него образовывали во многих регионах — от Кавказа до Поволжья и Средней Азии. Например, у кумыков, ногайцев, азербайджанцев или крымских татар слово «киши» входит в состав личных имён, прозвищ и, соответственно, фамилий.

Суффикс «-ев» в фамилии Кишиев указывает на русскую модель оформления, характерную для фамилий нерусского происхождения, которые адаптировали при вхождении в российскую имперскую административную систему. Фамилия образована по принципу «чей?» — то есть «сын Киши» или «потомок Киши». Само имя или прозвище Киши могло быть дано человеку по какой-то характерной черте (например, «настоящий мужчина», «свой человек») или же быть сокращением от более сложного составного имени, где «киши» выступало второй частью.

Встречается и другая, менее вероятная версия, связывающая фамилию с арабским именем Кашиф (означает «открывающий», «обнаруживающий»), которое в тюркской среде могло видоизмениться до «Киши». Но основная гипотеза — прямая связь с общеупотребительным словом «киши» — выглядит убедительнее, так как такие фамилии от нарицательных существительных (Человеков, Мужчин) встречаются повсеместно.

Географически фамилия Кишиева чаще всего фиксируется в регионах Северного Кавказа (особенно в Дагестане, Чечне, Ингушетии) и среди тюркских народов Поволжья. Носительница фамилии, скорее всего, происходит из среды, где тюркские языки были основными, а сама фамилия закрепилась за родоначальником, которого в общине знали просто как Киши — без дополнительных уточнений, что говорит о его известности или определённом положении.