Основой фамилии Кишинька послужило имя Акиша или Никиша. Скорее всего, Кишинька – усечённая уменьшительная форма мужского имени Акиша или Никиша. Первое из них восходит к церковному Иоаким, которое в переводе с древнееврейского означает «поставленный богом». Второе – производная форма от имени Никита, которое пришло в русский язык из греческого и означает «победитель». Менее вероятно, что в основе фамилии лежит болгарское или сербское дохристианское имя Киша, которое переводится как «дождь». Следовательно, такое имя мог получить ребёнок, родившийся в сырую погоду. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Акиша или Никиша, со временем получил фамилию Кишинька.