Фамилия Кишмария — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. Она отчетливо указывает на абхазское происхождение. Основа «Кишмария» — это русифицированная запись абхазской фамилии Кишмариа (или Кышмариа), которая распространена в Абхазии, особенно в селах Кутол, Атара и Очамчырском районе. В абхазском языке суффикс «-иа» (или «-риа») — типичный патронимический показатель, обозначающий принадлежность к роду: «из рода такого-то». То есть Кишмария буквально значит «потомок Кишмы».

С этимологической точки зрения сложнее. Абхазские родовые имена часто восходят к прозвищам, топонимам или архаичным личным именам, точное значение которых сегодня восстановить трудно. Есть версия, что основа «Кышма» или «Кишма» может быть связана с тюркским словом «кыш» (зима) — такое прозвище могли дать человеку, родившемуся в холодное время года или имевшему «зимний», суровый нрав. Но это лишь предположение, и для абхазской ономастики более характерна связь с местными топонимами или древними языческими именами.

Фамилия образована не по русской модели (суффиксы -ов/-ев, -ин здесь отсутствуют), а по абхазской: корень + родовой суффикс. В русском языке она закрепилась в форме Кишмария — с ударением, как правило, на второй слог (Кишма́рия), хотя в абхазском оригинале ударение может падать на первый. Носители этой фамилии — почти исключительно потомки абхазских дворян (князей или «тавадов») или крестьянских родов, в зависимости от конкретной ветви. Сословная принадлежность внутри абхазского общества была сложной, и по одной только фамилии её не определить — в Абхазии одни и те же родовые имена встречались и у знати, и у свободных крестьян.

В России и других странах бывшего СССР фамилия встречается крайне редко, в основном среди людей, чьи предки покинули Абхазию в советское время или в период Кавказской войны XIX века. Если вы носите эту фамилию, то с высокой вероятностью ваши корни — в одном из абхазских сел, а сама фамилия — прямое свидетельство родовой принадлежности, а не профессионального прозвища или отчества.