Фамилия Кисибеков — один из характерных примеров тюркско-русского пограничья в ономастике. Её основа — составное мужское имя Кисибек, которое строится по типичной для тюркских языков модели «существительное + титул/звание». Первая часть, «киси» (в разных диалектах — «кесе», «киши»), означает «человек, мужчина, лицо». Вторая, «бек» (или «бий»), переводится как «господин, князь, правитель», в более широком смысле — уважаемый человек, предводитель. Таким образом, имя Кисибек буквально значило «человек-господин» или «мужчина-князь» — не столько титул, сколько прозвище, данное человеку с выраженными лидерскими качествами или просто как пожелание стать таковым.

Русский суффикс -ов в фамилии указывает на стандартный способ русификации: в документах Российской империи тюркские имена и прозвища часто оформляли по образцу русских отчеств. Поэтому Кисибеков — это буквально «сын Кисибека» или «потомок Кисибека». Фамилия не древняя: она массово фиксируется в метрических книгах и ревизских сказках не раньше второй половины XIX века, когда у народов Кавказа, Поволжья и Средней Азии начали окончательно закрепляться наследственные фамилии.

Географически фамилия Кисибеков почти наверняка привязана к Северному Кавказу, в первую очередь к Дагестану и Чечне, а также к казахским и ногайским степям. У народов этих регионов имя Кисибек (иногда в форме Кесебек, Кишибек) встречается как личное, а фамилия на -ов — результат канцелярской записи. Интересно, что в некоторых тюркских языках слово «киси» могло приобретать ироничный оттенок («человечишка»), но в контексте имени-оберега это не исключено: давая ребёнку «сниженное» имя, родители пытались обмануть злых духов.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Кисилёв, Кисимов, Кисин — показывает, что все они происходят от разных вариантов одного корня, но Кисибеков стоит особняком: это не просто «человек», а «человек с титулом». В отличие от фамилий на -беков (Абдулбеков, Алибеков), где первая часть — арабское или тюркское имя, у Кисибекова первая часть — нарицательное, что делает фамилию более прозрачной по смыслу, но менее частотной. Носителей Кисибековых в России немного: по открытым данным, фамилия встречается в Дагестане, Казахстане и среди кавказских диаспор в крупных городах.