Фамилия Кисконьян — редкий пример фамилии, чья форма и звучание сразу выдают её географическое и этническое происхождение. Она образована по армянской модели с суффиксом -ян, который в русской передаче часто пишется как -ьян (с мягким знаком). Суффикс -ян (-ьян) означает принадлежность или происхождение: «из рода такого-то» или «сын такого-то». В основе фамилии лежит личное имя или прозвище Кискон.

Что скрывается за этим корнем? Самая вероятная версия — основа «киск» восходит к армянскому слову «киск» (գիսկ) или близкому диалектному варианту, означающему «локон», «прядь волос» или «коса». В таком случае прозвище Кискон мог получить человек с заметной причёской — длинными волосами, кудрями или, наоборот, с лысиной, когда «киск» употреблялось иронично. Менее распространённая гипотеза связывает «киск» с тюркскими языками, где похожие корни означают «отрезать» или «кусок», но для армянской фамилии это маловероятно: -ян — стойкий армянский патронимический суффиксальный элемент, и тюркская основа здесь была бы чужеродной.

Фамилия Кисконьян почти не встречается за пределами армянской диаспоры и исторических регионов расселения армян. В современной России её носители единичны, и основная масса, вероятно, сосредоточена в Армении или среди выходцев из Западной Армении (нынешняя восточная Турция), где фамилии с суффиксом -ян особенно распространены. Из-за редкости фамилия не попала в крупные ономастические словари русского языка, и её носители, скорее всего, принадлежат к одной или нескольким родственным ветвям.

Социальный контекст тут прост: армянские фамилии на -ян в массе своей не указывают на дворянское или крестьянское происхождение — они универсальны и охватывают все сословия. Кисконьян — типичная фамилия-прозвище по внешнему признаку, и её носитель в далёком прошлом, вероятно, отличался причёской или волосами, что и закрепилось в родовом имени.