Фамилия Кискин входит в обширную группу русских «звериных» фамилий, но её происхождение не столь однозначно, как может показаться. Основа фамилии — прозвище Киска. В народной традиции так могли назвать человека не только за внешнее сходство с кошкой, но и за характер. Хитрец, который «себе на уме», или же, наоборот, ласковый и симпатичный человек — оба варианта вполне могли закрепиться в прозвище.

Модель образования фамилии стандартна для русского Севера и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность «сын Киски» или «из семьи Киски». Это отличает фамилию от, скажем, Кискинский, где суффикс -ский выдавал бы дворянское или географическое происхождение.

Интересно, что в ономастике существует и другая версия, менее популярная, но не лишённая оснований. В некоторых говорах «киской» называли не только кошку, но и небольшой кожаный кошель или мешочек для табака. Если прозвище пошло от этого значения, предок мог быть торговцем, кожевником или просто человеком, носившим приметный кошель. Однако основная, кошачья версия остаётся более распространённой.

Фамилия не относится к числу частых, но встречается в центральных и северных регионах России. В документах XVII–XVIII веков, например, в переписных книгах Вологодчины и Архангельской губернии, можно найти крестьян с прозвищем Киска, что подтверждает народные корни фамилии. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это однозначно крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали метко и без затей.