Фамилия Киснерис на первый взгляд кажется нехарактерной для русской ономастики. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский, а окончание -ис наводит на мысль о литовском или латышском происхождении. Действительно, наиболее вероятная версия — что Киснерис представляет собой русифицированную или полонизированную форму балтийской фамилии. Её основа, скорее всего, восходит к литовскому слову kisnėti — «мешкать, копаться, возиться» или kisnus — «медлительный, кропотливый». В таком случае прозвище Киснерис (или Киснис) могли дать человеку неторопливому, основательному, либо, напротив, тому, кто постоянно копался и задерживал других.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с литовским kisnė — «кисет» (мешочек для табака или денег). Тогда прозвище могло относиться к ремесленнику, который шил такие кисеты, или к человеку, носившему с собой заметный кисет. Однако слово kisnė в литовском языке заимствовано из славянских языков, так что эта гипотеза уводит к той же славянской основе «кисет», которая в балтийской среде получила местное оформление.

С точки зрения словообразовательной модели, суффикс -ис в литовских фамилиях — типичный показатель мужского рода (ср. Будрис, Науялис). Окончание -ерис может быть результатом адаптации литовской фамилии на -eris или -aris, что характерно для фамилий, образованных от глаголов или существительных с помощью суффикса деятеля. Таким образом, Киснерис — это не случайное сочетание звуков, а вполне логичная балтийская фамилия, означавшая «медлительный человек» или «тот, кто возится».

Географически фамилия Киснерис встречается в основном на северо-западе России (Псковская, Ленинградская области), а также в Литве и Латвии. В приграничных с Прибалтикой регионах такие фамилии не редкость: они сохранились у потомков литовцев и латышей, которые в разное время переселялись на русские земли или попадали в зону влияния Российской империи. Сословной принадлежности предков Киснерисов по одной фамилии не определить — это мог быть и крестьянин, и мещанин, и ремесленник, но, судя по прозвищу, основой для фамилии послужила бытовая характеристика, а не социальный статус.

В дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться по-разному: Киснерис, Киснерись, Киснер, а иногда и с окончанием -ов (Киснерисов) — так писарь переделывал неудобное окончание на привычный русский лад. Поэтому, если в семейных архивах встречаются варианты, это не ошибка, а следствие бюрократической адаптации.