Основой фамилии Кийко послужило имя Киек. Несмотря на украинское происхождение, фамилия Кийко имеет тюркские корни. По одной из версий, она образована от персидско-мусульманского слова «кийка» - «повелитель». Согласно другой гипотезе, в основе этой фамилии лежит татарское имя Киек (от старотатарского слова «киек», которым обозначали объектов охоты (оленя, сайгу, косулю). Возможно, род Кийко ведет свое происхождение от Белека Кийкова, перешедшего на русскую службу в середине XVI века. В 1554 году служилым татарином он был направлен послом в Крым. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Киек, со временем получил фамилию Кийко.