Фамилия Кизерева — женская форма, мужская — Кизерев. В основе лежит прозвище, а не крестильное имя, что указывает на более позднее, бытовое происхождение. Словообразовательная модель проста: суффикс -ев присоединён к основе Кизерь. Этот суффикс характерен для фамилий, образованных от прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на мягкий согласный.

Самая прямая версия связывает прозвище Кизерь с диалектным глаголом «кизерить» — в северных и сибирских говорах он означает «гнусить», «говорить в нос», «привередничать», а также «шалить, проказничать». Человек с таким прозвищем мог обладать гнусавым голосом или, наоборот, отличаться капризным, вздорным нравом. В ономастике известен принцип «от противного»: прозвище часто давали не по постоянному качеству, а по случайной черте или детской привычке.

Менее вероятна, но допустима версия от тюркского корня «кизер» — «насилие», «принуждение». В этом случае прозвище мог получить человек суровый, властный. Однако для центральной России, откуда, скорее всего, родом носители фамилии, тюркское влияние слабее, чем для южных областей, поэтому версия с диалектным глаголом выглядит предпочтительнее.

Фамилия редкая, не входит в списки ста самых распространённых. Встречается преимущественно в Поволжье и некоторых областях Центральной России, что косвенно подтверждает связь с северным или среднерусским говором. Сословная принадлежность предков Кизеревых могла быть разной: прозвище не указывает на конкретное ремесло или титул, поэтому среди носителей могли быть и крестьяне, и мещане, и служилые люди низших чинов.

Особенность написания — ударение, скорее всего, падает на второй слог: Кизе́рева. В редких вариантах произношения ударение может смещаться на последний слог, но это уже влияние местного говора. Однокоренных фамилий, кроме Кизерев, практически нет, что делает её уникальной в своём роде.