Фамилия Кизым — один из тех редких случаев, когда носитель русского паспорта носит фамилию, которую проще всего объяснить из тюркских языков. Скорее всего, в её основе лежит тюркское слово «кызым» (в некоторых диалектах — «кысым»), что означает «моя дочь» или «девочка». В татарском, башкирском, казахском и других тюркских языках обращение «кызым» — это ласковое именование дочери или молодой девушки. Как такое обращение стало фамилией? Вероятнее всего, так могли прозвать человека, который часто употреблял это слово в речи, либо так называли единственную дочь в семье, которая осталась наследницей. В русской среде фамилии на тюркской основе не редкость, но Кизым — довольно редкий вариант.

Фамилия не имеет характерного русского суффикса (-ов, -ев, -ин), что говорит о её позднем закреплении или о том, что она могла прийти в русский язык из украинской или южнорусской традиции, где фамилии без суффиксов встречаются чаще. В украинском языке слово «козима» или «козим» могло бы быть связанным с козой, но фонетически Кизым ближе именно к тюркскому «кызым». Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия могла произойти от прозвища «Кизыма» — человека с каким-то дефектом речи, который «кизыкал» (неразборчиво говорил или картавил). Однако эта гипотеза не имеет серьёзной опоры в диалектных словарях.

Географически фамилия Кизым встречается в основном в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, а также в среде казачества. Это подтверждает тюркскую версию: именно в этих регионах исторически активно смешивались русские и тюркские народы. Сословно предки Кизымов могли быть как крестьянами, так и казаками, но точных данных о дворянском происхождении нет — фамилия не упоминается в родословных книгах.

В написании фамилии возможна вариативность: в старых документах можно встретить «Кызым» или «Кизем», но современная норма — с буквой «и» в первом слоге и твёрдой «ы» во втором. Ударение, судя по живому произношению, падает на второй слог: Кизы́м.