Фамилия Клантаев — редкая, и её разбор требует внимания к деталям, которые обычно ускользают при беглом взгляде. В первую очередь бросается в глаза суффикс -ев, который в русских фамилиях чаще всего указывает на происхождение от имени или прозвища, оканчивающегося на мягкий согласный или -й. Однако основа «Кланта» не похожа на привычные календарные или славянские имена.

Вероятнее всего, корень фамилии — тюркский. В языках тюркской группы (татарском, башкирском, казахском) есть слово «клантау» или «кланта» — в разных диалектах оно может означать «запор», «засов» или, в переносном смысле, «упрямый», «несговорчивый» человек. Прозвище Кланта могли дать человеку с тяжёлым, непокладистым характером, которого было трудно «отпереть» уговорами. Фамилии с таким корнем встречаются в среде поволжских татар и башкир, хотя в русифицированной форме Клантаев она могла закрепиться у крещёных татар или представителей других народов, перешедших в православие.

Нельзя исключать и более экзотическую версию, связанную с географическим названием. В некоторых регионах Средней Азии встречаются топонимы, созвучные «Кланта», например, урочища или небольшие речки. В таком случае фамилия могла возникнуть у человека, переселившегося оттуда, по модели «выходец из местности Кланта». Но это предположение менее обоснованно из-за редкости самого топонима.

С точки зрения словообразования, Клантаев — это типичная русская патронимическая фамилия (отчество), построенная по схеме «прозвище + -ев». Она не имеет уменьшительных суффиксов, что говорит о её относительно позднем оформлении, когда прозвище уже воспринималось как основа фамилии, а не как ласкательное имя. В дореволюционных списках фамилия практически не фиксируется — это указывает на её локальное бытование, возможно, в среде сельских жителей определённого уезда. Сегодня носители Клантаевых встречаются в основном в Башкортостане, Татарстане и соседних областях, что подтверждает тюркскую версию происхождения. Написание с «а» после «т» (а не «я») — ещё один аргумент в пользу восточного источника, поскольку в русской передаче тюркские мягкие гласные часто заменяются на «а».