Фамилия Клаутов — редкий случай, когда русская фамилия по форме (суффикс -ов) почти наверняка имеет нерусские корни. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться, как она могла попасть в русский язык и что означала исходная основа.

Самая вероятная версия — немецкая. Фамилия Клаутов — это русифицированный вариант немецкой фамилии Клаут (Klaut). В Германии имя Клаут возникло как сокращённая форма от более длинных имён, содержащих древнегерманские корни hlut («ясный, светлый») или liut («люди»). Самый известный пример такого имени — Людвиг. То есть исходно Клаут могло быть домашним, уменьшительным именем, которое со временем закрепилось как фамилия и пришло в Россию вместе с носителями, вероятно, в XVIII–XIX веках, когда в стране появилось много немецких переселенцев, ремесленников и специалистов.

Суффикс -ов в фамилии Клаутов — стандартный русский патронимический показатель, отвечающий на вопрос «чей?». Он указывает, что главу семьи, носившего прозвище или фамилию Клаут, в русской среде стали называть Клаутовым, то есть «сыном Клаута» или «человеком из рода Клаутов». Это типичная модель адаптации иноязычных фамилий на русской почве.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с балтийскими языками. По ней, в основе лежит литовское слово kliauti — «гнуть», «прижимать». От него могло образоваться прозвище Клаут, которое дали человеку по профессии или характерному занятию — например, кузнецу, бондарю или колеснику, чья работа была связана с изгибанием металла или дерева. В этом случае фамилия могла возникнуть в западнорусских землях, где исторически было сильное литовское и польское влияние. Однако эта версия уступает немецкой по распространённости: фамилии с корнем klaut- встречаются в немецких источниках гораздо чаще, чем в литовских.

Таким образом, фамилия Клаутов — это, скорее всего, след немецкой миграции, переоформленный по русским словообразовательным законам. Её носители — потомки выходцев из Германии, чей предок носил краткое имя Клаут, или, с меньшей вероятностью, потомки балтийских ремесленников. География фамилии в России неширокая, что подтверждает её локальное и относительно позднее происхождение.