Фамилия Клаутовы хранит память о происхождении своих носителей, и в ней переплелись как минимум две культурные традиции — немецкая и балтийская. Наиболее вероятно, что это русская версия немецкой фамилии Клаут. В Германии она восходит к имени Клаут — краткой форме нескольких древнегерманских имён с основой (h)lut, что значит «ясный, светлый», или liut — «люди». Самое известное из таких полных имён — Людвиг. Так что предок Клаутовых мог получить фамилию по имени отца, которого в быту звали Клаут.

Есть и вторая версия, балто-русская. Согласно ей, в основе фамилии лежит прозвище Клаут, образованное от литовского глагола kliauti — «гнуть», «прижимать». Такое прозвище могло относиться к профессиональным занятиям человека: возможно, он гнул дуги, полозья или занимался другим ремеслом, где требовалось сгибать и прижимать материал.

Фамилия Клаутовы — самобытный памятник, но процесс её формирования мог быть долгим и не привязанным к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте её происхождения можно лишь после серьёзных генеалогических изысканий.