Основой фамилии Клавкин послужило церковное имя Клавдий. Фамилия Клавкин восходит к мужскому календарному личному имени Клавдий. Имя Клавдий произошло от латинского Claudius - «хромой», римское родовое имя. Прилагательное claudus было одним из эпитетов хромоногого бога Вулкана, Геффеста. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Клавка, со временем получил фамилию Клавкин.