Фамилия Клодницкая — редкий случай, когда географическое имя перешло в фамилию почти без изменений, сохранив польский отпечаток. Основа здесь — топоним Клодница (польск. Kłodnica): так называется река на юге Польши, приток Одера, а также несколько населённых пунктов в Силезии и Малопольше. Формант -цк- типичен для польской модели образования фамилий от названий мест: кто был родом из Клодницы или владел землёй рядом с ней, получал прозвание Клодницкий. Женская форма Клодницкая, соответственно, закрепилась за дочерью или женой такого человека.

Слово «клодница» в основе может восходить к древнепольскому «kłoda» — бревно, колода. Тогда название реки или села могло означать «запруженная река» или «место, где рубили лес». Но связь с конкретным польским топонимом выглядит убедительнее: фамилия почти не встречается за пределами бывшей Речи Посполитой, и её носители — потомки шляхты или крестьян, переселившихся из тех краёв на восток, в земли современной Беларуси, Украины и западной России.

В России фамилия единична. Её можно встретить в старых метрических книгах Витебской и Могилёвской губерний, куда в XIX веке переезжали польские и ополяченные семьи. Ударение, судя по польскому оригиналу, падает на второй слог: Клоднúцкая. В русском быту его часто смещают на третий, но исходный вариант сохраняет связь с географией.

От других фамилий на -цкий Клодницкую отличает именно конкретная привязка к реке, а не к прозвищу или имени. Это не «сын Клода» и не производное от «клодник» (лесоруб), хотя такие версии иногда выдвигают. Словарь польских фамилий К. Рымута прямо указывает на топонимическое происхождение, и это самый надёжный след.