Фамилия Клогчков — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное слово. Если произнести её вслух, слышится «Клочков» — и это ключ к разгадке. Фамилия образована от прозвища или мирского имени Клочок, которое давали человеку с клочковатой, неровной бородой или неопрятными волосами. В южнорусских и белорусских говорах «клочок» означало также небольшой клок земли, надел, так что прозвище могло относиться к крестьянину, владевшему крошечным участком. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Клочка».

Необычное написание Клогчков — скорее всего, результат диалектного произношения или ошибки писаря. В русских говорах звук [ч] перед [к] мог оглушаться или заменяться на [г] в некоторых позициях, особенно в северных и сибирских регионах. Кроме того, в дореволюционных документах фамилии записывали на слух, и вариант Клогчков мог закрепиться в конкретной семье из-за особенностей местного говора или неграмотности переписчика. Встречается и обратный процесс: фамилию Клочков иногда ошибочно пишут как Клогчков, путая буквы.

Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков: прозвище на -ок + суффикс притяжательности. Аналогов много: Клочков, Клоков, Клокотов. Фамилия Клогчков — не вариант Клочкова, а самостоятельная, хоть и редкая, ветвь, возникшая в результате фонетического сдвига. По данным современных справочников, она встречается спорадически, в основном на Урале и в Сибири, что подтверждает гипотезу о её северном или переселенческом происхождении.

Сословно предки Клогчковых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала, что тоже говорит о её «низовой» природе. Никаких известных исторических деятелей с такой фамилией нет, но это не умаляет её ценности как маркера живой народной речи, сохранившейся в письменном виде.