Фамилия Клокели — одна из тех, что ставит исследователя перед вопросом: это исконно русское образование или заимствованная основа, перекроенная под русскую словообразовательную модель? Скорее всего, перед нами второй случай. В русской ономастике нет продуктивного корня «клокел-», а окончание «-и» в фамилиях такого типа чаще всего указывает на польское или западнорусское происхождение, где -и выступает как окончание родительного падежа или характерный суффикс фамилий шляхетского типа.

Наиболее вероятная версия: фамилия восходит к польскому слову kłokiel или kłok — так в диалектах называли клок, клок шерсти, пучок, комок. В переносном смысле прозвище Клокель могли дать человеку с лохматой, торчащей шевелюрой или неухоженной бородой. В польском языке есть и глагол kłokotać — «клокотать, бурлить», что могло бы относиться к шумливому, вздорному человеку, но это менее вероятно, так как прозвища от глагольных форм редко застывают в такой форме.

Менее правдоподобная, но встречающаяся гипотеза — связь с тюркскими языками, где kökäl или kökeli означает «голубоватый, сизый». Однако в этом случае фамилия скорее писалась бы как Кекели или Кёкели, а не Клокели. Славянская версия объясняет и написание, и суффикс.

Фамилия редкая. В дореволюционных справочниках и списках она почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании — возможно, в белорусских или украинских землях, где польское влияние на фамилии было особенно сильным. Если предки носили Клокели, они могли быть мещанами или крестьянами из западных губерний Российской империи, чью фамилию записали на слух, адаптировав под местное произношение. Сословного барьера фамилия не несёт: в Польше носители фамилий на -и могли быть и шляхтичами, и крестьянами.