Фамилия Клокина — женская форма фамилии Клокин, а та в свою очередь образована от прозвища или нецерковного имени Клока. В основе лежит слово «клок» — пучок, клочок, комок чего-то (шерсти, волос, сена). Прозвище Клока могли дать человеку с растрёпанными, торчащими в разные стороны волосами, либо тому, кто постоянно ходил в рваной одежде, буквально «клочьями». Есть и другая версия: в некоторых говорах «клок» означало «ком земли» или «кусок глины», так что прозвище могло относиться к гончару или земледельцу.

Фамилия образована по простой и распространённой модели: основа «Клок» + суффикс -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Клокин — сын Клоки. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов. В южных и восточных регионах ту же основу превратили бы в Клоков.

Интересная деталь: фамилия Клокин и её женская форма Клокина не так редки, как может показаться. Встречаются они по всей России, но заметный клан есть в Вологодской и Архангельской областях. На Русском Севере «клок» долго сохранял значение «клок шерсти» — там держали овец, и прозвище могло закрепиться за пастухом или валяльщиком шерсти. В то же время в псковских и тверских говорах «клок» — это ещё и «клок земли», что снова отсылает к крестьянскому быту.

Однокоренные фамилии — Клоков, Клочков (уменьшительное от «клок»), Клокотов. Но Клокина выделяется тем, что её основа не уменьшительная, а прямая: не «клочок», а именно «клок». Это делает её более архаичной — такие прозвища чаще давали в XV–XVII веках, до массового закрепощения крестьян и стандартизации фамилий. Так что предки современных Клокиных, скорее всего, были вольными крестьянами или ремесленниками на севере России.