Фамилия Клошко звучит на слух как типичная украинская или белорусская, и это верное направление. Её основа — прозвище или профессия, а суффикс -ко указывает на происхождение с земель современной Украины, Беларуси или юга России. В славянской ономастике формант -ко (как в фамилиях Шевченко, Коваленко) часто означал «сын» или «потомок», но мог и просто закрепиться за прозвищем без патронимического смысла.

Корень «клош-» ведёт к нескольким возможным источникам. Первый и самый прямой — польское или западноукраинское слово «клош» (klosz) в значении «колпак», «чехол», «стеклянный купол» (от немецкого Glocke — колокол). Так могли прозвать мастера, который делал колпаки для ламп или стеклянные изделия, либо человека, носившего необычный головной убор. Второй вариант — диалектное «клош» как «клюшка», «крюк»; тогда прозвище мог получить пастух с посохом или рыбак. Третий, менее вероятный, — от глагола «клочить» (чесать лён, трепать), но такая основа дала бы фамилию вроде Клочко, а не Клошко.

Встречаемость фамилии Клошко невысока, но она сосредоточена в западных областях Украины (Львовская, Тернопольская) и в Беларуси, что подтверждает связь с польским языковым влиянием. В дореволюционных метрических книгах носители чаще всего значились крестьянами или мещанами. Сословной элиты среди Клошко не было — это фамилия простых людей, получивших прозвище по ремеслу или внешней примете.

Стоит обратить внимание на редкую особенность: фамилия Клошко почти не встречается в России за пределами южных областей, куда переселялись украинцы. Это отличает её от однокоренных Клочко и Клочев, которые шире распространены. Если искать дальние параллели, то в чешском языке есть слово «kloš» — «обрубок», но для восточнославянской фамилии это уже натяжка. Самая правдоподобная версия — прозвище мастера по стеклу или колпакам, укоренившееся в западноукраинском регионе.