Фамилия Коёкин — один из тех редких случаев, когда разбор прозвища-основы уводит в диалектную лексику сразу двух регионов. В её основе лежит прозвище Коёка, которое, скорее всего, образовано от владимирского глагола «коекать» — «бестолково спрашивать, ходить разиней». Во владимирских говорах «коёка» означала «разиня, ротозей». Значит, прозвище указывало на черту характера — рассеянность или чрезмерную любопытность.

Есть и вторая версия, но она заметно слабее. В пермских говорах словом «коек» называли род весельца, лопаточки, которой опираются, бегая на лыжах. Если принять эту гипотезу, то Коёкой могли прозвать лыжника. Однако связь между «коеком» (предметом) и прозвищем Коёка (человеком) менее очевидна, а владимирское значение объясняет форму прозвища прямее и проще.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе прозвища Коёк- добавили суффикс принадлежности -ин, который отвечает на вопрос «чей?». Коёкин — буквально «сын Коёки», «потомок Коёки». Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин особенно часты.

Найти фамилию в исторических документах непросто: она редкая и не попала в крупные дореволюционные справочники. Точное время и место её возникновения можно установить только через локальные генеалогические разыскания — переписи, ревизские сказки, метрические книги конкретных уездов. Но уже сейчас ясно: перед нами не книжная, а живая фамилия, выросшая из диалектного прозвища, которое дали человеку в деревне.