Фамилия Когягина — женская форма, мужской вариант — Когягин. Её происхождение неочевидно, и это как раз тот случай, когда стандартная модель «от имени или прозвища» требует осторожности.

Словообразовательная структура прозрачна: основа «Когяг-» и суффикс -ин (в женском роде -ина). Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Когягин, то есть сын или потомок Когяги. Вопрос упирается в саму основу.

Самая вероятная гипотеза — диалектное или иноязычное происхождение прозвища. В русских говорах северных и сибирских регионов фиксируется слово «когя» или «когяга» — так могли называть человека с характерной походкой, сутулого или сгорбленного (ср. диалектное «кокориться» — гнуться, ломаться). В этом случае фамилия образована от прозвища, данного по внешнему признаку или манере держаться.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркскими языками. В татарском и башкирском есть корень «күгә» (синеватый, голубоватый) или «күгәрчен» (голубь). Тогда «Когяга» могло быть прозвищем человека со светлыми глазами или любителя голубей. Однако переход «күгә» → «Когяга» требует допущений и не подтверждён массовым бытованием фамилии в тюркоязычных регионах.

География фамилии узкая. По данным современных телефонных справочников и архивов ЗАГС, основная масса носителей Когягиных сосредоточена на юге Западной Сибири — в Алтайском крае и Новосибирской области. Это косвенно подтверждает первую версию: сибирские говоры сохранили архаичную лексику, и прозвище могло закрепиться именно там.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Когяев, Когяков, Когятин) показывает, что все они крайне редки и имеют ту же региональную привязку. Это говорит о локальном, а не общерусском характере основы.

Сословная принадлежность предков неясна. Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах, что типично для крестьянских или мещанских фамилий, возникших в XVIII–XIX веках после закрепления обязательных фамилий для податных сословий.