Фамилия Кохновер — редкий случай в русском ономастиконе, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Окончание -ер выбивается из привычных русских фамильных моделей (-ов, -ин, -ский) и прямо указывает на западное, скорее всего немецкое или еврейское (идиш) происхождение. В немецком суффикс -er часто обозначает жителя местности или человека по роду занятий. Таким образом, Кохновер — это не «сын Кохна», а «тот, кто из Кохнова» или «тот, кто имеет отношение к Кохну».

Самая вероятная основа — топоним Кохнов (Kohnow). Такое название встречается в Германии (например, в земле Бранденбург) и в исторических областях расселения евреев-ашкеназов в Восточной Европе. Если фамилия немецкая, её носитель происходил из деревни или поместья Кохнов. Если же она принадлежит к еврейскому пласту фамилий (что не менее вероятно, учитывая распространённость модели «топоним + -ер» среди ашкеназов), то предок мог быть выходцем из местечка с похожим названием, например, Кохново на территории современной Беларуси или Польши.

Второй вариант, менее распространённый, но допустимый: основа Кохн- может восходить к прозвищу или профессии. В немецком диалектах «Koch» — повар, а «Kohne» или «Kohn» — иногда искажённая форма имени Конрад (Konrad). Тогда Кохновер — это, условно, «повар из определённой местности» или «потомок Конрада». Однако, учитывая редкую форму на -ер, скорее всего, перед нами именно географическая фамилия, а не профессиональная: для обозначения повара в немецком языке есть прямая фамилия Кох или Кохен, без наращения.

В России фамилия Кохновер встречается очень редко и, как правило, у потомков переселенцев — либо немецких колонистов, приглашённых Екатериной II, либо еврейских семей, переехавших в черту оседлости. В отличие от массовых русских фамилий, она не меняла окончание по падежам (мужская и женская формы одинаковы — «Иван Кохновер» и «Анна Кохновер»), что только подтверждает её иноязычное происхождение. Точных данных о дворянстве или крестьянском сословии нет, но, судя по модели, предки были скорее ремесленниками, торговцами или арендаторами — людьми, чья фамилия привязана к месту жительства, а не к владению землёй.