Фамилия Кокодиняк — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с украинским или южнорусским диалектным словом «кокод» или «кокода». В говорах Черниговщины, Полтавщины и прилегающих областей России так называли заносчивого, важного человека, а иногда — неряху или неопрятного мужчину. Слово экспрессивное, звукоподражательного происхождения, родственное «кокотать» (кудахтать), но в переносном смысле описывало поведение.

Суффикс -як — один из характерных маркеров западноукраинских и подольских фамилий (ср. Бондаряк, Гончаряк, Коваляк). Он указывал на принадлежность или связь: Кокодиняк — «сын или потомок Кокоди». Встречается и вариант с суффиксом -ак, но в данном случае -як закрепился, вероятно, под влиянием местного произношения. Форма «Кокодин-» — это основа с усечением конечного гласного прозвища (Кокода → Кокодин), а затем добавление фамильного суффикса.

Географически фамилия почти не выходит за пределы западной Украины. Встречается в архивных записях XIX века по Волынской и Подольской губерниям. Никаких связей с дворянскими родами или казацкой старшиной нет — это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали по характеру или внешнему виду, а не по ремеслу.

Ошибочно связывать Кокодиняк с птицей «кокоди» (такого слова в русском и украинском языке нет) или с греческим корнем. Единственная реалистичная версия — диалектное прозвище. Если предок получил его, то, скорее всего, за манеру держаться с преувеличенной важностью или, наоборот, за неряшливость — в зависимости от того, какое значение бытовало в конкретной местности.