Фамилия Кокодий — редкая и неоднозначная по происхождению. Ее основа неочевидна, что сразу наталкивает на несколько версий, и разобраться в них помогает анализ суффикса и возможных корней.

Суффикс -ий указывает на притяжательное значение (чей? — Кокодий). Такая модель характерна для украинских и белорусских фамилий, образованных от прозвищ или имен. В русской традиции чаще встречается окончание -ов/-ев, так что Кокодий, скорее всего, имеет западнорусские или украинские корни. Ударение, вероятно, падает на последний слог — Кокодíй.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с прозвищем, данным человеку с необычной внешностью или поведением. В основе может лежать диалектное слово «кокод» — так в некоторых говорах называли неуклюжего, нескладного человека или, наоборот, того, кто «кокодится», то есть важничает, ломается. Сравните с глаголом «кокетничать» (от французского coquet) — не исключено, что прозвище Кокод мог получить щеголь или франт. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия не связана с каким-либо ремеслом или географическим названием, а значит, образована от личной характеристики.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками. В ряде тюркских наречий «кок» означает «синий» или «зеленый», а «одий» может быть искаженным вариантом слова «оглы» (сын). Тогда Кокодий могло бы означать «сын синеглазого» или «сын неба». Однако эта версия слабая: фамилия не имеет типичных тюркских окончаний (-ов, -ев), и в украинской среде она встречается чаще, чем в татарской.

Есть и вариант, что фамилия — это искаженная форма крестильного имени. Например, от греческого имени Никодим (победитель народа) через народное переосмысление «Кокодим». Но и здесь нет прямых доказательств.

Географически фамилия Кокодий встречается в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в прилегающих районах Беларуси. В России она редка и фиксируется в единичных случаях. Это еще раз подтверждает ее локальное, диалектное происхождение.

Таким образом, предок носителя фамилии Кокодий, скорее всего, получил прозвище за свои манеры или внешность — был либо заметным щеголем, либо, наоборот, неловким человеком. Точное значение утрачено, но сама фамилия сохранила колорит народной речи.