Фамилия Коковинец, скорее всего, образована от прозвища, которое давали человеку, переехавшему из одного из сел или деревень с названием Коковино. Такие поселения встречаются в России — например, известны село в бывшей Витебской губернии и деревня в Московской области. В старину переселенцам часто давали прозвище по месту, откуда они пришли: «Коковинец» — тот, кто родом из Коковина.

Само название Коковино, вероятно, восходит к устаревшему слову «кокова». В народных говорах так называли палку с корневищем, набалдашник или резное украшение на коньке избы. Такая деталь была заметной и характерной, могла лечь в основу прозвища или названия местности. Поэтому вполне вероятно, что основатель рода Коковинец был уроженцем одного из таких населенных пунктов.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия редкая. Суффикс -ец в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность к местности: ср. Ростовец, Тверец. В сочетании с основой Коковин- (от названия Коковино) получается типичная «географическая» фамилия, распространенная в северных и центральных губерниях России. Такая модель встречается реже, чем фамилии на -ов или -ин, что делает Коковинец заметной в ряду однокоренных.