Фамилия Колайдо — редкий случай в русском ономастиконе. Она не укладывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, и это сразу подсказывает, что перед нами не исконно русская фамилия, а скорее всего греческого происхождения. Вероятнее всего, она восходит к греческой фамилии Καλαϊτζής (Kalaïtzís) или Καλαϊδής (Kalaïdís), которые в русской передаче могли адаптироваться как Колайдо или Калайдо. В греческом языке основа связана с καλάι (kalaï) — «олово» или «жесть», а суффикс -τζής (-tzís) указывает на профессию. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть жестянщиком, лудильщиком или мастером по оловянным изделиям.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с греческим именем Калай (Καλαής) или его вариантами, где корень означает «красивый» или «добрый». Но профессиональная гипотеза выглядит убедительнее, так как фамилии ремесленников часто переходили в русскую среду через греческих переселенцев — купцов, моряков или мастеровых, осевших в южных портах Российской империи, например в Одессе, Таганроге или Керчи.

Написание «Колайдо» с буквой «о» в первом слоге — типичный результат адаптации греческого звучания к русской фонетике: безударное греческое «а» могло перейти в «о» в диалектах или при записи на слух. Окончание -о, не свойственное русским фамилиям, тоже выдаёт иноязычную основу; в греческом оригинале оно могло быть утрачено или трансформироваться под влиянием украинской или южнорусской речи, где фамилии на -о встречаются чаще.

Встречается фамилия и в форме «Калайдо» — это более близкий к исходнику вариант, но «Колайдо» закрепилась в документах, возможно, из-за ошибки писаря или диалектного произношения. В любом случае, носители этой фамилии — потомки греческих переселенцев, и их родословную стоит искать в греческих общинах Причерноморья или в метрических книгах православных церквей юга России XIX века.