Фамилия Колибрин — редкий случай в русской ономастике, где прозвище, скорее всего, связано с профессией или предметом быта, а не с именем или животным. Вопреки интуиции, колибри — маленькая птичка — тут ни при чём: слово «колибри» вошло в русский язык только в XIX веке, когда фамилия уже давно существовала.

Корень фамилии — «колибр-» — восходит к диалектному глаголу «колибровать» или «калибровать». В ремесленной среде так называли мастера, который подгонял, выверял размеры, калибровал детали. В северных и центральных говорах «колибром» могли называть также слесаря, настройщика инструментов или человека, занимающегося точной подгонкой — например, в оружейном или столярном деле. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Колибра», то есть прозвище отца перешло к детям.

Встречается фамилия в основном в центральной России и Поволжье, единичные записи — в старых метрических книгах Тульской и Рязанской губерний. Второй, менее вероятный вариант происхождения — от редкого дохристианского имени Колибор (славянское «коло» — круг и «бор» — борьба, защита), но такая антропонимическая модель для крестьянской среды нехарактерна.

Интересная деталь: в XIX веке фамилию иногда записывали через «а» — Калибрин, что прямо указывает на связь с калибром. Однако написание через «о» закрепилось в большинстве документов, возможно, под влиянием местного акающего произношения. Носители фамилии Колибрин — почти поголовно ремесленники или мастеровые, а не дворяне: в родословных книгах эта фамилия не встречается.