Фамилия Комаев — это на самом деле фонетический вариант фамилии Камаев. Она возникла под влиянием «окающих» говоров, где звук «а» в безударном положении произносится как «о». Поэтому, услышав фамилию, её могли записать на слух как Комаев, хотя корень у неё татарский.

Исходная фамилия Камаев восходит к старинному татарскому роду. Его родоначальником считается казанский князь Камай, который в 1550 году, перед решающим штурмом Казани, перешёл на сторону Ивана IV. После падения Казани он принял крещение и получил христианское имя Смиленей. За ним сохранилось поместье под Казанью — до сих пор существует село Князь Камаево.

Имя Камай встречается и в более поздних документах XVII века. Например, в 1608 году в Нижнем Новгороде упоминается помещик Камай Григорьевич Косливцев, а в 1662 году — казанский житель Камай Садилов.

Само имя Камай — это диалектная форма арабского имени Камалетдин. В переводе на русский оно означает «совершенство религии». Таким образом, фамилия Комаев (как и Камаев) буквально значит «потомок Камая»: человек, которого в роду звали Комай (или Камай), дал начало фамилии.