Фамилия Комиссар — один из тех случаев, когда профессиональное прозвище напрямую перешло в наследственное имя, почти не изменившись. Вопреки ожиданиям, это довольно старая фамилия, хотя её основа звучит для нас вполне современно. В старину комиссаром называли не военного комиссара советского образца, а должностное лицо, которому поручали ответственное дело (от латинского commissio — «поручение»). Такие чиновники — судьи, смотрители, сборщики податей — встречаются даже в «Вечерах на хуторе близ Диканьки» Гоголя, что подтверждает бытовое употребление слова в Малороссии и центральных губерниях ещё в XIX веке.

Интересно, что в русском языке слово «комиссар» пришло из польского komisarz, а туда — из немецкого и латыни. Поэтому фамилия Комиссар чаще встречается в западных регионах бывшей Российской империи: на Смоленщине, в Беларуси и на Украине, где польское влияние было сильнее. Прозвище могли дать не только чиновнику, но и управляющему имением, доверенному лицу помещика — в народе таких людей тоже называли комиссарами.

По словообразовательной модели фамилия Комиссар — это бессуфиксная форма, когда прозвище закрепилось без добавления типичных родовых окончаний (-ов, -ин). Это характерно для украинской и южнорусской традиции: в отличие от северных «Комиссаровых», здесь фамилия осталась в исходном виде. Такой тип встречается реже, чем патронимы на -ов, и указывает на то, что прозвище было очень устойчивым и общеизвестным.

Если ваш предок носил фамилию Комиссар, он, скорее всего, происходил из среды служилых людей или зажиточных крестьян, выполнявших административные поручения. Впрочем, не исключён и ироничный вариант: в некоторых говорах «комиссаром» в шутку называли бойкого, хлопотливого человека, который всюду совал свой нос. Но основная версия — профессиональная, и она же самая правдоподобная.