Фамилия Комиссина — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа — слово «комиссия», которое звучит скорее как название учреждения, чем как личное прозвище. Однако в России XVII–XIX веков так могли назвать человека, имевшего отношение к серьёзным поручениям или начальству. Латинский корень comitare («созывать на народное собрание») дал жизнь целому гнезду понятий, но в русском быту прозвище Комиссия, скорее всего, закрепилось за чиновником высокого ранга — тем, кто сам раздавал «комиссии», то есть ответственные задания.

Вероятна и другая, более прозрачная версия: фамилия образована от слова «комиссар». В дореволюционной России комиссаром называли должностное лицо, которому доверяли особое поручение (ту же «комиссию»). Такие персонажи встречаются даже у Гоголя в «Вечерах на хуторе близ Диканьки» — значит, слово было на слуху и легко превращалось в уличное прозвище. Если предок носил прозвище Комиссар или Комиссий, его потомки получали фамилию с типичным русским суффиксом -ин, который указывает на принадлежность роду: «чей?» — Комиссина, то есть дочь или вдова Комиссия.

Интересно, что фамилия закрепилась именно в женской форме Комиссина, а не в мужской Комиссин. Это говорит о том, что в документах фамилию могли записать сначала на вдову или дочь, а затем передать по наследству. Географически фамилия встречается в основном на северо-западе России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её связь с канцелярской или административной средой — именно там чиновники и «комиссии» были в ходу.