Фамилия Кордегенго — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели образования русских фамилий: в ней нет славянских суффиксов -ов, -ин, -ский, а основа звучит иноязычно. Скорее всего, перед нами фамилия западноевропейского происхождения, адаптированная к русскому произношению и письму.

Наиболее вероятная версия — немецкое или голландское происхождение. В немецком языке фамилия могла выглядеть как Kordegen или Kordeggen. Разложим её на части: «Kord» — вариант имени Konrad (Конрад) или, реже, топоним, а «-egen» (от «Gegen» — «против») или «-gen» (суффикс, указывающий на происхождение). Вторая часть, «-gen», часто встречается в северогерманских и нижненемецких фамилиях и означает «родом из» или «принадлежащий». Таким образом, Кордегенго могло означать «потомок Корда» или «человек из местности Корд». Окончание «-го» в русской записи — это, скорее всего, искажённое немецкое окончание, которое при переносе в русский язык получило характерное «-о» (как в фамилиях Шульго, Гофго).

Вторая, менее правдоподобная версия — итальянские корни. В итальянском существует фамилия Cordegengo, которая могла быть связана с географическим названием или прозвищем. Однако для русского бытования такая фамилия гораздо менее типична, чем немецкая.

В России носители фамилии Кордегенго — большая редкость. Встречается она в основном в центральных регионах и, по косвенным данным, могла появиться у потомков обрусевших немцев или выходцев из Прибалтики, где немецкое влияние было сильным. Сословной принадлежности по одной фамилии определить нельзя: Кордегенго мог быть и мастеровым, приглашённым в Россию при Петре I, и отставным солдатом, и купцом. Точных сведений о знаменитых носителях нет — фамилия остаётся малоизученной и крайне локальной.