Фамилия Косоножкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не требует расшифровки: «косоножка» — человек с кривыми, не прямыми ногами. Такая внешняя примета была одной из самых устойчивых в русской антропонимии: косолапого, хромого или просто несуразно сложенного человека легко могли прозвать Косоножкой, а его дети и внуки становились Косоножкиными. В говорах «косоножка» могло означать и особую походку вразвалку, и даже неловкость в движениях — не обязательно физический дефект, а скорее заметную манеру.

Суффикс -кин указывает на принадлежность: Косоножкин — чей? — сын Косоножки. Это типичная патронимическая модель, но не от имени, а от прозвища. Такие фамилии чаще всего складывались в северных и центральных землях России, где было принято называть по отцу с суффиксом -ин/-ын, а не -ов. Если бы прозвище звучало как Косоног, фамилия была бы Косоногов; форма на -ожка — более разговорная, почти ласкательная, хотя и с насмешливым оттенком.

Поскольку фамилия недворянская и не встречается в родословных книгах, её носители, скорее всего, происходили из крестьян или посадских людей. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировали «по глазам»: записывали не по имени, а по тому, как человека отличали в деревне. Косоножкин — не переосмысленное иноязычное слово и не искусственное изобретение семинаристов (те любили греческие и латинские корни), а чисто бытовая фамилия, возникшая в живой речи.

Интересно, что у фамилии есть «родственники»: Косолапов, Косоруков, Кривоногов — все они построены по той же схеме «признак + часть тела». Но Косоножкин стоит особняком из-за редкого суффикса -ожк-, который почти не встречается в других прозвищах (обычно говорят «кривоножка», но фамилия Кривоножкин практически не фиксируется). Это делает фамилию лексически уникальной: она сохранила народное слово, которое сейчас почти вышло из обихода. В современных говорах «косоножка» уже не встретишь, а вот в переписных книгах XVII века такое прозвище могло быть вполне обыденным.