Фамилия Костаганов звучит как пришлая, нерусская, но её механизм образования — чисто русский, суффиксальный. Основа «Костаган» скорее всего восходит к тюркскому имени или прозвищу, а окончание «-ов» указывает на то, что её носитель — потомок человека, которого звали Костаган. Это типичная модель для адаптации иноязычных имён в русской среде: к чужому корню приращивают славянский суффикс принадлежности.

Сама основа «Костаган» может быть сложносоставной. В тюркских языках «кос» означает «парный», «двойной», а «таган» — это тренога для котла, металлическая подставка для костра. В переносном смысле «костаган» могли прозвать человека, который носил с собой или делал такие таганы, либо того, кто был «двойным», то есть хитрым или имевшим двойную функцию. Вторая, более вероятная версия — имя восходит к тюркскому слову «костак» (или «костаклы»), что значит «крепкий», «коренастый», но с изменением конечного звука под влиянием русского уха.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам России, Поволжью и Приуралью, где исторически было сильное татарское, башкирское или казахское влияние. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: возможно, предок был выходцем из конкретного аула или станицы, где прозвище закрепилось за одним родом. Сословно носители фамилии могли быть как казаками, так и крестьянами или мещанами, принявшими фамилию по отцу.

В русском языке у фамилии нет однокоренных аналогов, что подчёркивает её изолированность. Если и есть варианты вроде Костагановых, то они — результат орфографической вариативности, а не другого корня. Таким образом, фамилия Костаганов — это яркий пример того, как тюркское прозвище, связанное с бытом или характером, обрело русскую форму и сохранилось в памяти потомков.