Фамилия Котанидис — почти стопроцентный маркер греческого происхождения. В русском ухе она звучит непривычно, но для греческой ономастики её устройство прозрачно. Основа «Котан-» восходит к греческому мужскому имени Ко́тас (Κώτας) или его вариантам. Это имя, в свою очередь, — сокращённая, «домашняя» форма от полных имён вроде Константи́нос (Константин) или Кондо́с (Κόντoς, «короткий»). В греческих деревнях такие усечения были нормой: вместо длинного официального имени в быту использовали короткое, а потом оно закреплялось за родом.

Суффикс «-идис» (греч. -ίδης) — классический патронимический показатель, означающий «сын такого-то» или «потомок». По происхождению он древний, из той же модели, что и в фамилиях античных героев (Атрид — сын Атрея). В новогреческом языке суффикс -ίδης стал одним из самых распространённых способов образования фамилий, особенно в Малой Азии и на островах. Таким образом, Котанидис буквально значит «сын Ко́таса» или «из рода Ко́таса». Фамилия не указывает напрямую на профессию или сословие — она чисто родовая, по имени предка.

Географически фамилия Котанидис чаще всего встречается среди греков — выходцев из Понта (историческая область на южном берегу Чёрного моря, ныне в Турции). Для понтийских греков характерны фамилии именно на -идис, в то время как в материковой Греции распространены суффиксы -пулос, -оглу или -акис. После обмена населением между Грецией и Турцией в 1920-х годах многие Котанидисы оказались в Северной Греции (Македония, Фракия). В России и странах бывшего СССР носители этой фамилии — преимущественно потомки греческих переселенцев, бежавших от геноцида в начале XX века или приехавших по экономическим причинам.

В русском языке фамилия не склоняется по падежам, если речь идёт о мужчине: «Я встретил Котанидиса», но «Я встретил Котанидис» (о женщине). Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Котани́дис, как того требует греческая норма произношения. Встречающиеся варианты написания — Котаниди, Коттанидис — связаны с упрощением при передаче кириллицей или с диалектными особенностями.

Словообразовательная модель фамилии (греческая основа + патронимический суффикс) не имеет аналогов в традиционных русских фамилиях на -ов или -ин, поэтому её носители в России — это почти всегда потомки греческих иммигрантов. Если ваш предок носил фамилию Котанидис, он с высокой вероятностью происходил из Понта или из греческих общин Причерноморья, а его прямой предок по мужской линии носил имя Котас.