Фамилия Ковдерко звучит для русского уха как нечто украинское или белорусское — и это верное чутьё. Суффикс -ко в восточнославянских фамилиях чаще всего указывает на происхождение с территории современной Украины или юга Беларуси. В XVI–XVII веках такие фамилии закреплялись за казаками, мещанами и крестьянами, часто как уменьшительная или «сыновья» форма: Ковдерко буквально означает «маленький Ковдер» или «сын Ковдера».

Основа ковдер- — спорная, но наиболее вероятно, что это искажённое или диалектное произношение слова «ковёр» (украинское «ковдер» или «ковдра»). В украинском языке «ковдра» — это одеяло, но в некоторых говорах так могли называть и сам ковёр. Тогда прозвище Ковдер мог получить ткач, торговец коврами или человек, носивший пёструю, «ковровую» одежду. Менее убедительная версия возводит фамилию к немецкому фамильному имени Kauder (от Kauderer — болтун, говорун), но для украинской среды это маловероятно: заимствование скорее бытовое, чем личное.

Географически фамилия Ковдерко концентрируется в западных и центральных областях Украины — в частности, в Житомирской, Хмельницкой и Винницкой областях. Встречается и в Беларуси, но реже. В России носители Ковдерко — это, как правило, потомки переселенцев конца XIX — начала XX века, когда крестьяне из малоземельных губерний уходили на восток.

С точки зрения социальной истории, Ковдерко — фамилия недворянская. В реестрах казацкой старшины или польской шляхты она не фигурирует. Это крестьянская или мещанская фамилия, образованная от прозвища по роду занятий. Её носители в большинстве своём были ремесленниками или вольными хлеборобами, а в советское время — колхозниками и рабочими.

Необычность фамилии в том, что её корень не угадывается сразу: ковёр — слово общеславянское, а вот ковдер — форма, закрепившаяся именно в украинских говорах. Если бы фамилия была великорусской, она звучала бы как Коверков или Ковров. Суффикс -ко надёжно выдаёт её южное происхождение.