Фамилия Кожейкина — женская форма фамилии Кожейкин, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. Вопреки ожиданию, основа здесь не «кожа» в прямом значении, а прозвище Кожейка. Такое прозвище в русских говорах давали либо человеку, который имел дело с кожей (скорняку, кожевнику), либо тому, кто отличался смуглой кожей. Суффикс -ейк- в данном случае уменьшительно-пренебрежительный, как в словах «скамейка» или «копейка», и он мог смягчать прозвище: не просто «Кожевник», а «Кожейка» — малый кожевник или даже просто «кожаный» (по цвету лица).

Модель образования фамилии типична для русского Севера и центральных областей: сначала от прозвища на -ейка образовалась фамилия Кожейкин (чей? — сын Кожейки), а затем, по патронимической традиции, появилась форма Кожейкина для женщин. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречались у дворян и купцов, фамилии на -ин, как Кожейкин, были распространены среди крестьян и мещан: они образовывались от слов на -а/-я, и суффикс -ин указывал на принадлежность роду конкретного человека.

Географически фамилия Кожейкин (и её женская форма) привязана к регионам, где активно развивалось кожевенное ремесло: это Нижегородская, Костромская и Вологодская губернии. В документах XVII–XVIII веков можно встретить упоминания крестьян с прозвищем Кожейка или Кожейко в Вятской и Пермской землях — там кожевенное дело часто сочеталось с кузнечным или сапожным промыслом.

Стоит отметить редкую особенность: фамилия Кожейкина сохранила архаичный суффикс -ейк-, который в современном русском языке почти не участвует в образовании прозвищ. Это значит, что фамилия могла закрепиться в письменных источниках ещё в допетровскую эпоху, когда такие формы были живыми. Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Кожевников, Кожин, Кожанов, — то Кожейкин стоит особняком: он не называет ремесло напрямую, а сохраняет личное, возможно, насмешливое прозвище предка.

Таким образом, носительница фамилии Кожейкина может быть уверена: её предки, скорее всего, были не просто ремесленниками, а людьми с характером — прозвище «Кожейка» могло закрепиться за смуглым или задиристым человеком, который и в кожевенном деле, и в быту был «себе на уме».