Фамилия Козлиебищенко — редкий случай, когда прозвище сохранилось в почти неприкрытом виде, не зашлифованное веками до благозвучной фамилии. Она относится к украинской модели фамилий на -енко, которая в XVI–XVII веках закрепилась в Поднепровье, Слобожанщине и на юге России. Суффикс -енко в те времена означал «сын» или «потомок»: Козлиебищенко — это «сын Козлиебища» или, что точнее, «сын того, кого прозвали Козлиебище».

Основа фамилии — прозвище Козлиебище. Оно составное: «козёл» + «бить» (в значении «убивать» или «колотить»). В русских и украинских говорах «козлиебище» дословно — «тот, кто бьёт козлов». Но за этим прямым значением, скорее всего, стоит не ремесло, а насмешливое прозвище. В крестьянской среде прозвища часто давали по характерной черте поведения, внешности или нелепому случаю. Человек мог получить такое прозвище, если однажды неудачно охотился на козла, дрался с соседом по прозвищу Козёл или просто обладал упрямым, «козлиным» нравом, а односельчане в шутку говорили, что его нужно «бить».

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: прозвище могло быть связано с ритуальным или обрядовым действом. В народной культуре козёл — частый персонаж святочных игрищ, ряженья. «Бить козла» могло означать исполнять роль в обряде или разыгрывать сцену. Но для фамилии, закрепившейся в документах, более правдоподобна бытовая, а не обрядовая основа.

Фамилия уникальна тем, что сохранила грубоватый прямой корень, который в официальных метриках могли бы «причесать» до более благозвучного варианта — например, Козловский или Козленко. Тот факт, что она осталась в форме Козлиебищенко, говорит о том, что предок-носитель жил в достаточно замкнутой среде, где прозвище не казалось оскорбительным, а воспринималось как отличительный знак. Сейчас фамилия встречается единично, в основном на юге России и восточной Украине, что подтверждает её локальное происхождение.