Фамилия Крекбаева — женская форма, а её мужской вариант — Крекбаев. Основа фамилии — имя или прозвище Крекбай. Это составное тюркское имя, где первая часть «крек» — искажённое «керек» (нужный, необходимый), а вторая — «бай» (господин, богач, хозяин). В сумме Крекбай означает «нужный господин» или «необходимый богач». Такие имена давали в казахской и других тюркских средах, желая ребёнку, чтобы он был ценным и важным для рода.

Формант «-ев» — стандартный русский патронимический суффикс, который добавили к основе при оформлении фамилии в русскоязычных документах. В самой казахской среде фамилия могла бы звучать как Крекбайулы (сын Крекбая) или Крекбайкызы (дочь Крекбая). Переход на русскую модель фамилий произошёл в XIX–XX веках, в основном при переписях населения и паспортизации в СССР.

Географически фамилия Крекбаева наиболее вероятна в Казахстане и среди казахов, живущих в приграничных с Казахстаном регионах России (Астраханская, Оренбургская, Омская области). Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении — от одного родоначальника или небольшой родовой группы. Предки носителей фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, а само имя Крекбай могло закрепиться за основателем рода, которого в общине считали незаменимым человеком.

Однокоренных фамилий с той же основой «крек» почти нет. Встречается редкая фамилия Крекбаев, а также более распространённые варианты с «керек» — Керекбаев, Керекбай. Это указывает на то, что Крекбаев — результат фонетического упрощения (выпадение гласного) в живой речи, что характерно для многих тюркских имён при записи на русский лад.